A gestão do Centro Universitário Católico Salesiano Auxilium – UniSALESIANO é exercida por uma reitoria, composta dos seguintes membros:

Reitor: Paulo Fernando Vendrame, nascido em Piacatu (SP), Sacerdote Salesiano, Educador e Gestor. Professou como religioso na Congregação Salesiana ano de 1987. Cursou e concluiu a Licenciatura Plena em Filosofia (1989), Bacharelado em Teologia (1995) e o Mestrado em Administração (2005). Autor do livro “Mercado e Missão: Implicações mútuas para uma escola Salesiana” (Editora Raízes, Lins, SP, 2001). Foi Diretor Administrativo da Obra Social Paulo VI em Campo Grande (1996-1997), Diretor Administrativo do Complexo Salesiano de Lins: Colégio, Faculdades e Clínica escola (1998-2000). Nomeado Diretor Geral do Colégio Salesiano Dom Bosco, em Campo Grande (2001-2002), Ecônomo Inspetorial da “Missão Salesiana de Mato Grosso”-MSMT, mantenedora de Escolas, Obras Sociais, Faculdades, Centro Universitário e Universidade nos Estados de Mato Grosso, Mato Grosso do Sul e Oeste Paulista  (2002-2004);  Nomeado Diretor das Faculdades Salesianas de Lins (SP), acompanhou a fusão e o credenciamento pelo MEC/INEP, de três Instituições de Ensino Superior, em um novo Centro Universitário, “Unisalesiano”, sendo seu primeiro Reitor (2004-2010); Diretor pastoral/pedagógico do CSSG de Cuiabá (2011-2015) e Diretor Geral do Colégio Salesiano São Gonçalo em Cuiabá (2016-2019). Em 2020, retorna a Lins, como Diretor Geral do UniSALESIANO Lins e em 2021, nomeado Reitor do Centro Universitário Católico Salesiano Auxilium – Sede Lins e Campus Araçatuba.

Pró-Reitor Ensino, Pesquisa e Pós-Graduação: Prof. André Ornellas, educador, atualmente Pró-Reitor Ensino, Pesquisa e Pós-Graduação do Centro Universitário Católico Salesiano Auxilium. Em 2019 ocupou o cargo de Vice-Reitor do Unisalesiano. Coordenador da comissão de recredenciamento em 2019, tendo como resultado a nota máxima do MEC 5. Coordenador responsável do Credenciamento do EAD em 2019, tendo como resultado a nota máxima do MEC 5. Coordenador responsável da Equipe de implantação, autorização e início do curso de Medicina junto ao Unisalesiano de Araçatuba, o qual foi vencedor do edital nº 06/2014. Doutor em Ciências Empresariais pela UNISUL/UMSA (2006-2009). MBA em Gestão da Tecnologia de Informação; MBA em Ciências Gerenciais – Gestão de Tecnologia e Inovação; Especialista em Gerência Contábil, Financeira e Auditoria; Especialista em Computação Gráfica; Bacharel e, Graduado em Pedagogia e Ciências Contábeis. Membro do Consu – Conselho Universitário Unisalesiano. Membro do corpo editorial das revistas Universitas, eHumanit@s, eSaleng e eUnisalesianoS@úde. Desde 1988, voluntário junto ao Oratório Dom Bosco. Desde 1998, Organizador Voluntário do Projeto Cidadania Responsável da Justiça Eleitoral em Araçatuba. Consultor no período de 1993-2000 no Instituto das Apóstolas do Sagrado Coração de Jesus. Membro do Conselho Municipal de Políticas Culturais junto a Prefeitura Municipal de Araçatuba, nos períodos de 2011-2012, 2013-2014, 2015-2017, 2018-2020 e 2020 – 2022. Secretário Executivo de Assistência e Desenvolvimento Social no Centenário de Araçatuba – ano 2007-2008. Membro da Comissão de atualização do Projeto de Desenvolvimento Institucional. Desde 2001, participante das Conferências das Instituições Universitárias Salesianas. Em 2011, participante do  CWCU Education Seminar on China Education.